纤维束成像
正在载入数兆字节的流线数据。
流线的三维模型,按所选数量均匀抽样;大脑显示时也一并包含在内,切割方式与屏幕上相同。
文章性质
纤维束图是依据扩散 MRI 对大脑布线的重建:扫描仪测量每个体素中水分子可以自由运动的方向;由于水沿神经纤维运动比横穿纤维更容易,这些测量便勾勒出轴突束所走的路径。这里的每一根线都是一条流线,即对白质中一条此类路径的估计。
颜色并不表示组织类型或测量值——它们表示纤维在该点的走向,这是该领域的标准惯例:
或者,在视图旁方框的“纤维束”部分选择“按纤维束”,图谱命名的 46 条纤维束便各有自己的颜色,与该领域的图谱画法一致;无论使用哪种着色,轻点一根纤维都会显示它所属纤维束的名称。
拖动可转动大脑,在视图上捏合或滚动可缩放。“切片”位于工具栏靠左处,它会在视图的每条边上各放一个滑块,每个滑块都从该侧切去大脑及其中的流线:把滑块拖回中心标记即可撤销它的切割,“视图”下的“重置切片”可撤销全部切割,关闭“切片”则一切恢复完整。“大脑”用于显示或隐藏纤维周围的 MNI152 大脑,其画法与三维脑区图谱相同,切面上也像那里一样显示 MRI;其旁的“脑区”显示或隐藏高亮显示的脑区本身;“透明度”会弹出两根竖条,分别对应大脑和脑区,各自让其更透明或更不透明。“纤维束”用于显示或隐藏流线。“纤维束切片”在每次打开“切片”时都会开启,使流线随大脑一起被切割;关闭它,流线保持完整,只切割大脑。“偏移”让流线的切断端伸出大脑切面,“距离”设定伸出多少毫米,大脑关闭时这两项都呈灰色;“加粗”设定流线绘制的粗细。“视图”把大脑转到它的某一面,或回到页面打开时的视图;“旋转”让大脑持续转动,直到你抓住它为止;位于工具栏末端的“导出”可将流线和大脑导出为三维模型。视图旁的脑区框可通过边缘的标签收起:其中的脑区由下文的“纤维束关联”高亮,即点按某一纤维束的流线所终止的脑区;高亮某个脑区时,只绘制穿过它的流线;开启“脑区”后,该脑区本身会以其颜色立于流线之间,像大脑一样被切割,并像在三维脑区图谱中那样显示在大脑切面上。框顶部的开关可选“全部经过”,即穿过任一高亮脑区的每条流线;“终止于”,即只显示有一端位于某个高亮脑区的流线(流线止于该脑区内或距其两毫米以内,即算作一端;纤维束成像让线条止于灰质前不远处,而止于脑干的一端不属于任何脑区,因为图谱没有标注脑干);或在高亮两个及以上脑区时选“连接”,即只显示一端位于一个高亮脑区、另一端位于另一个高亮脑区的流线,添加第二个脑区时开关会自动转到此项。点按脑区名称可打开它的说明。脑区下方的“纤维束”部分按系统列出图谱命名的纤维束:联络纤维、投射纤维、连合纤维、小脑纤维和脑神经。“左”和“右”用于显示或隐藏纤维束的每一侧,开关则用于整个系统或全部纤维束;轻点一根纤维,会在一个小窗口中显示它所属纤维束的名称。在列表中点按纤维束的名称,或在那个小窗口中点按“单独显示”或名称,即可选中该纤维束:它会被单独显示;工具栏上的第一个按钮“纤维束关联”在选中纤维束之前呈灰色,它会弹出一个面板,介绍该纤维束连接什么、我们认为它有什么作用、损伤会造成什么,以及其流线终止的脑区和各脑区在末端中所占的比例,点按其中一个即可将其高亮;颜色开关下方的“以灰色显示其他纤维束”会用同一种素淡的灰色把其余纤维束留在视图中,让所选纤维束在它们当中显出自己的位置;再次点按名称或点按“显示全部纤维束”,则重新显示所有纤维束。绘制的流线越少,画得就越精细:平滑成曲线,也更圆润;流线密集之处着色更深,从而显示出纵深。页面打开时,大脑以 65% 的透明度显示,流线开启,没有任何切割;其余设置则保留你离开时的样子:流线的开关、偏移和粗细,高亮的脑区及其两个开关,显示的纤维束及其着色,以及视图。这是群体平均结果,而非某一个人的大脑,因此它显示的是人们普遍共有的通路。
参考文献
纤维束图 HCP1065 群体平均纤维束成像图谱:Yeh FC, Population-based tract-to-region connectome of the human brain and its hierarchical topology, Nat Commun 13:4933 (2022), CC BY-SA 4.0.
大脑 MNI152 模板(ICBM 2009c),McConnell Brain Imaging Centre, Montreal Neurological Institute;以三维脑区图谱的画法绘制在流线周围,切开处显示 MRI。
数据 provided in part by the Human Connectome Project, WU-Minn Consortium (Principal Investigators: David Van Essen and Kamil Ugurbil; 1U54MH091657) funded by the 16 NIH Institutes and Centers that support the NIH Blueprint for Neuroscience Research; and by the McDonnell Center for Systems Neuroscience at Washington University.
渲染 NiiVue(Rorden 实验室)。